RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251287.2

HCN2-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN2, Length 3,408 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2-201ENST00000251287 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.65■■□□□ 1.38
HCN2-201ENST00000251287 GRIN2AQ12879 1464 aa23.64■■□□□ 1.38
HCN2-201ENST00000251287 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
HCN2-201ENST00000251287 LAMC1P11047 1609 aa23.64■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 MBD3O95983 291 aa23.63■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 SYNJ2O15056 1496 aa23.63■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 ERVK-7P63135 1459 aa23.62■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.62■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 MYOM1P52179 1685 aa23.61■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.61■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TSPYL6Q8N831 410 aa23.6■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.6■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.59■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 ATP10BO94823 1461 aa23.59■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TMX3Q96JJ7 454 aa23.59■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 SDSP20132 328 aa23.58■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.58■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 TMEM51Q9NW97 253 aa23.58■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.58■■□□□ 1.37
HCN2-201ENST00000251287 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CASC1Q6TDU7 716 aa23.58■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 FBLN1P23142 703 aa23.57■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 ERICH4A6NGS2 130 aa23.57■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.57■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 TTC22Q5TAA0 569 aa23.56■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 USP48Q86UV5 1035 aa23.55■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 KCNJ4P48050 445 aa23.55■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CABP2Q9NPB3 220 aa23.55■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CD109Q6YHK3 1445 aa23.54■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.54■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.53■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 MADDQ8WXG6 1647 aa23.53■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 HMOX1P09601 288 aa23.53■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.52■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 ZNF592Q92610 1267 aa23.52■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 FIBPO43427 364 aa23.52■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 IQGAP1P46940 1657 aa23.52■■□□□ 1.36
HCN2-201ENST00000251287 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 PHF14O94880 888 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 KANK1Q14678 1352 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 NOS1P29475 1434 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 ABCC11Q96J66 1382 aa23.51■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 SHPRHQ149N8 1683 aa23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 CEP152O94986 1710 aa23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.49■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 PTPRTO14522 1441 aa23.49■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 REC8O95072 547 aa23.49■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 43.8
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HCN2-201ENST00000251287 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.48■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 DRC7Q8IY82 874 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 NPHP1O15259 732 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 BRD1O95696 1058 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 PALD1Q9ULE6 856 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 IFT57Q9NWB7 429 aa23.46■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 PRKAR2BP31323 418 aa23.46■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 AFAP1Q8N556 730 aa23.46■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.46■■□□□ 1.35
HCN2-201ENST00000251287 ERC2O15083 957 aa23.45■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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HCN2-201ENST00000251287 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 STK26Q9P289 416 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 LRMPQ12912 555 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 KDM4AO75164 1064 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 VAMP4O75379 141 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 SLC24A1O60721 1099 aa23.42■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.42■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.41■■□□□ 1.34
HCN2-201ENST00000251287 IFT140Q96RY7 1462 aa23.41■■□□□ 1.34
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