RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa42.71■■■■■ 4.43
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INO80B-201ENST00000233331 CRB1P82279 1406 aa42.63■■■■■ 4.42
INO80B-201ENST00000233331 POLR3GLQ9BT43 218 aa42.63■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 RGPD5Q99666 1765 aa42.62■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 ABCC6O95255 1503 aa42.62■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 TCP11L2Q8N4U5 519 aa42.62■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 LTN1O94822 1766 aa42.61■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 COG3Q96JB2 828 aa42.61■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 BARGINQ6ZT62 677 aa42.6■■■■■ 4.41
INO80B-201ENST00000233331 EP400Q96L91 3159 aa42.6■■■■■ 4.41
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INO80B-201ENST00000233331 CARD10Q9BWT7 1032 aa42.43■■■■■ 4.38
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INO80B-201ENST00000233331 AMPHP49418 695 aa42.35■■■■■ 4.37
INO80B-201ENST00000233331 NLRP2Q9NX02 1062 aa42.35■■■■■ 4.37
INO80B-201ENST00000233331 CGNL1Q0VF96 1302 aa42.34■■■■■ 4.37
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INO80B-201ENST00000233331 HOXC9P31274 260 aa42.32■■■■■ 4.37
INO80B-201ENST00000233331 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
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INO80B-201ENST00000233331 DISP2A7MBM2 1401 aa42.31■■■■■ 4.36
INO80B-201ENST00000233331 DDB1Q16531 1140 aa42.31■■■■■ 4.36
INO80B-201ENST00000233331 RTL1A6NKG5 1358 aa42.3■■■■■ 4.36
INO80B-201ENST00000233331 DEFB132Q7Z7B7 95 aa42.3■■■■■ 4.36
INO80B-201ENST00000233331 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
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INO80B-201ENST00000233331 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa42.21■■■■■ 4.35
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INO80B-201ENST00000233331 TNS2Q63HR2 1409 aa42.17■■■■■ 4.34
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INO80B-201ENST00000233331 IL2RBP14784 551 aa42.16■■■■■ 4.34
INO80B-201ENST00000233331 KIF24Q5T7B8 1368 aa42.15■■■■■ 4.34
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INO80B-201ENST00000233331 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa42.14■■■■■ 4.34
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INO80B-201ENST00000233331 USHBP1Q8N6Y0 703 aa42■■■■■ 4.31
INO80B-201ENST00000233331 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.99■■■■■ 4.31
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INO80B-201ENST00000233331 CAMKK2Q96RR4 588 aa41.96■■■■■ 4.31
INO80B-201ENST00000233331 PARD3Q8TEW0 1356 aa41.93■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 PTF1AQ7RTS3 328 aa41.91■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa41.9■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
INO80B-201ENST00000233331 RREB1Q92766 1687 aa41.87■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 ACSBG1Q96GR2 724 aa41.86■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 NHSQ6T4R5 1651 aa41.86■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 TATP17735 454 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
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