RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 RUNDC1Q96C34 613 aa23.88■■□□□ 1.41
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CBX1-201ENST00000225603 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.87■■□□□ 1.41
CBX1-201ENST00000225603 HMOX1P09601 288 aa23.87■■□□□ 1.41
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CBX1-201ENST00000225603 ABCC6O95255 1503 aa23.63■■□□□ 1.37
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CBX1-201ENST00000225603 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.54■■□□□ 1.36
CBX1-201ENST00000225603 STRN4Q9NRL3 753 aa23.53■■□□□ 1.36
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CBX1-201ENST00000225603 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.53■■□□□ 1.36
CBX1-201ENST00000225603 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CBX1-201ENST00000225603 HSPA1LP34931 641 aa23.52■■□□□ 1.36
CBX1-201ENST00000225603 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CBX1-201ENST00000225603 MCM10Q7L590 875 aa23.51■■□□□ 1.35
CBX1-201ENST00000225603 JCADQ9P266 1359 aa23.51■■□□□ 1.35
CBX1-201ENST00000225603 EVA1CP58658 441 aa23.51■■□□□ 1.35
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