RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 NUBP1P53384 320 aa24.3■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PIK3C2AO00443 1686 aa24.3■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.3■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 C19orf67A6NJJ6 358 aa24.29■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.27■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRNA2Q15822 529 aa24.27■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CPDO75976 1380 aa24.27■■□□□ 1.48
PLGRKT-201ENST00000223864 HAX1O00165 279 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC24A1O60721 1099 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 GCP02774 474 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP6P59044 892 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 RASEFQ8IZ41 740 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 TESK2Q96S53 571 aa24.26■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.25■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.24■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.24■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 SLIT3O75094 1523 aa24.24■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.24■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.23■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.23■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.21■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.21■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 USP47Q96K76 1375 aa24.21■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 TMC1Q8TDI8 760 aa24.21■■□□□ 1.47
PLGRKT-201ENST00000223864 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.2■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 STRN4Q9NRL3 753 aa24.19■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 EVA1CP58658 441 aa24.18■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.17■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.17■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 COL18A1P39060 1754 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 USP54Q70EL1 1684 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A0G2JS52 829 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 MYT1Q01538 1121 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.16■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.15■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC125Q86Z20 511 aa24.15■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.15■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.15■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD5Q99666 1765 aa24.14■■□□□ 1.46
PLGRKT-201ENST00000223864 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 TMF1P82094 1093 aa24.13■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 SPOCK2Q92563 424 aa24.13■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A1W2PP64 1363 aa24.13■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 EP400Q96L91 3159 aa24.13■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 USP31Q70CQ4 1352 aa24.12■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.11■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 NFAT5O94916 1531 aa24.1■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.09■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 NME9Q86XW9 330 aa24.09■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 USP35Q9P2H5 1018 aa24.09■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 BARGINQ6ZT62 677 aa24.08■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.08■■□□□ 1.45
PLGRKT-201ENST00000223864 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 LTN1O94822 1766 aa24.07■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 SOX12O15370 315 aa24.07■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 CDCA8Q53HL2 280 aa24.07■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.06■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 CRB1P82279 1406 aa24.06■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.05■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC6O95255 1503 aa24.04■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.03■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PLGRKT-201ENST00000223864 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.01■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.01■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.01■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.01■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 WNK3Q9BYP7 1800 aa24■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 MYOM1P52179 1685 aa23.99■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM182BQ5T319 152 aa23.99■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 PDE3BQ13370 1112 aa23.97■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.96■■□□□ 1.43
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.95■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 COG3Q96JB2 828 aa23.95■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.94■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.94■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.94■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC37A3O60309 1634 aa23.92■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 FYB1O15117 783 aa23.91■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms