RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP53Q96M91 514 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 SHPRHQ149N8 1683 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA3Q99758 1704 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0232Q92628 1395 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD5Q99666 1765 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS2O95450 1211 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 IL13P35225 146 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 FLT4P35916 1363 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.82■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 IP6K1Q92551 441 aa24.82■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 FAM83GA6ND36 823 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 HMOX1P09601 288 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 INSRP06213 1382 aa24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 COL18A1P39060 1754 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 EYA1Q99502 592 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NUDCQ9Y266 331 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 JCADQ9P266 1359 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 CPDO75976 1380 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 RTL1A6NKG5 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF4Q96M43 638 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 STRN4Q9NRL3 753 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 BTG4Q9NY30 223 aa24.7■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LRP6O75581 1613 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 ERBB3P21860 1342 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PRKAR2BP31323 418 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 APAF1O14727 1248 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 C8orf37Q96NL8 207 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 NEUROD2Q15784 382 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 EVA1CP58658 441 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 USP35Q9P2H5 1018 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO41Q8TF61 875 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FCHSD2O94868 740 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 RUNDC1Q96C34 613 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP8Q14318 412 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 NGLY1Q96IV0 654 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.58■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 KDRP35968 1356 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC6O95255 1503 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 NEFLP07196 543 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 SLIT2O94813 1529 aa24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 NRAPQ86VF7 1730 aa24.51■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 RIPK4P57078 832 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 MEGF6O75095 1541 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 NCAPD2Q15021 1401 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 DCTN1Q14203 1278 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 USP21Q9UK80 565 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CRB1P82279 1406 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 AFF2P51816 1311 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 NEFMP07197 916 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms