RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3R1P27986 724 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 GPAT3Q53EU6 434 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 FUT10Q6P4F1 479 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 STK32CQ86UX6 486 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PARGQ86W56 976 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CEP44Q9C0F1 390 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SMPD1P17405 629 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LRPAP1P30533 357 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CDC73Q6P1J9 531 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC103Q8IW40 242 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SVOPQ8N4V2 548 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 GPR156Q8NFN8 814 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.846e-6■■■■□ 21.9
CTDP1-208ENST00000613122 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 AVILO75366 819 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LGR5O75473 907 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 KRT33AO76009 404 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TSHRP16473 764 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CSNK2BP67870 215 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 STRADAQ7RTN6 431 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 REEP1Q9H902 201 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRJQ12913 1337 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PEX11AO75192 247 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 OTCP00480 354 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0D1P61421 351 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PARP15Q460N3 678 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 HYIQ5T013 277 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 S100A13Q99584 98 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SERHLQ9NQF3 203 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TSPAN1O60635 241 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CYP3A5P20815 502 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ECM1Q16610 540 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CDRT15Q96T59 188 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PALMDQ9NP74 551 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL1Q9NR64 748 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 NAGLUP54802 743 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 WNT3AP56704 352 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CREG2Q8IUH2 290 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC10Q969S8 669 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 AP5Z1O43299 807 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 C1RP00736 705 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ELP6Q0PNE2 266 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 RNF148Q8N7C7 305 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TCF25Q9BQ70 676 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SYN3O14994 580 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 TGFB1I1O43294 461 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 EPHX1P07099 455 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SLC5A3P53794 718 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ATRNO75882 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 MYL12BO14950 172 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 INAQ16352 499 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 BNIPLQ7Z465 357 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LINGO1Q96FE5 620 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 BTBD9Q96Q07 612 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 FGRP09769 529 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 WASP42768 502 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CORO7P57737 925 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PRKCZQ05513 592 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF605Q86T29 641 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PGM2Q96G03 612 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 MYBL2P10244 700 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 POTEHQ6S545 545 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms