RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289		O00370	1275 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ALOX15B	O15296	676 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LPXN	O60711	386 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CAND2	O75155	1236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM127	O75204	238 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SUN1	O94901	812 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	VNN1	O95497	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ERBB2	P04626	1255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RALA	P11233	206 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	IVD	P26440	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PCK1	P35558	622 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEA4	P43358	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RASSF2	P50749	326 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGA8	P53708	1063 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL4C	P56559	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MXRA7	P84157	204 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SP4	Q02446	784 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT88	Q13099	833 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPS	Q13938	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	VGLL4	Q14135	290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PDK2	Q15119	407 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	CNGA2	Q16280	664 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	UBR7	Q8N806	425 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TBCB	Q99426	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	COL4A5	P29400	1685 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	SI	P14410	1827 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ENPP3	O14638	875 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	LIAS	O43766	372 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	ULK1	O75385	1050 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRM-215	ENST00000583289	GH1	P01241	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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