RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TTC9	Q92623	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TANK	Q92844	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CERS2	Q96G23	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PSME4	Q14997	1843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TAF1	P21675	1872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	FAM170A	A1A519	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ACOX3	O15254	700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CLOCK	O15516	846 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MTSS1	O43312	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GRID2	O43424	1007 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SCO2	O43819	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	BNIP3L	O60238	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	B4GALT4	O60513	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DDHD2	O94830	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PTTG1	O95997	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CCNE2	O96020	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	VDR	P11473	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EPB42	P16452	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PCSK2	P16519	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TFEB	P19484	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	FUT4	P22083	530 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	RBL1	P28749	1068 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ATIC	P31939	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	RFC2	P35250	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	HPCAL1	P37235	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	RXRG	P48443	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRPC1	P48995	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GLUD2	P49448	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TKTL1	P51854	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EFNA5	P52803	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KCNQ4	P56696	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	IGBP1	P78318	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	BNIP3	Q12983	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GRIK2	Q13002	908 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	IL18R1	Q13478	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ACOX1	Q15067	660 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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