RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF214Q8ND24 703 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFT43Q96FT9 208 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 BMFQ96LC9 184 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF599Q96NL3 588 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPEGQ15772 3267 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLON5A6NGN9 336 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 A6NNZ2 444 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 MUSKO15146 869 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAD51BO15315 384 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFSF14O43557 240 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAFKO60675 156 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTA2O94776 668 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 THEGLP0DJG4 465 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CR2P20023 1033 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMPD1P23109 780 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RENBPP51606 427 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PFN3P60673 137 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 FOXC1Q12948 553 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 DPYSL3Q14195 570 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 AGERQ15109 404 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TCEAL1Q15170 157 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 INAVAQ3KP66 663 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SRLQ86TD4 932 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CNGA4Q8IV77 575 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 NETO2Q8NC67 525 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR13H1Q8NG92 308 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSPH1Q92598 858 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 KLK6Q92876 244 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 GATA6Q92908 595 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 FATE1Q969F0 183 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CENPTQ96BT3 561 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAF2Q96CS3 445 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSKH2Q96QS6 385 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHP1Q99653 195 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF670Q9BS34 389 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SP110Q9HB58 689 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 FZD3Q9NPG1 666 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 GGT7Q9UJ14 662 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 INTUQ9ULD6 942 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITM2BQ9Y287 266 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFAP69A5D8W1 941 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 POM121BA6NF01 834 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF487B1APH4 448 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF223E7ERA6 249 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 DFFAO00273 331 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 TOR1BO14657 336 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 AKR1B10O60218 316 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PALMO75781 387 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2CP4-201ENST00000561405 PIGNO95427 931 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms