RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549484.5

DUXAP9-202, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DUXAP9, Length 596 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAP9-202ENST00000549484 GRM3Q14832 879 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CFAP58Q5T655 872 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 Q6ZSR6 202 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PGBD5Q8N414 524 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 EID2Q8N6I1 236 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TC2NQ8N9U0 490 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF599Q96NL3 588 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CDC6Q99741 560 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 RBSNQ9H1K0 784 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 GPR27Q9NS67 375 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 BPTFQ12830 3046 aa11.35□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 FPGTO14772 594 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TM7SF2O76062 418 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 C1QTNF9P0C862 333 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 MAN1A1P33908 653 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 MMP12P39900 470 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 RXRGP48443 463 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CSNK1DP48730 415 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 SCNN1BP51168 640 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 MAXP61244 160 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 BCL2L1Q07817 233 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ELP6Q0PNE2 266 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 DNAJC3Q13217 504 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 UGP2Q16851 508 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CCDC157Q569K6 752 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PAF1Q8N7H5 531 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 KCTD6Q8NC69 237 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 RFFLQ8WZ73 363 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 PSKH2Q96QS6 385 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF670Q9BS34 389 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 SEPT3Q9UH03 358 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.34□□□□□ -0.59
DUXAP9-202ENST00000549484 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 ENC1O14682 589 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 TNFSF14O43557 240 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 KRT7P08729 469 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 C6P13671 934 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 CR2P20023 1033 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 MMP13P45452 471 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RABIFP47224 123 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RENBPP51606 427 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 AP1S1P61966 158 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RALGDSQ12967 914 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 FZD2Q14332 565 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 IRF4Q15306 451 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 ERAP2Q6P179 960 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 PARGQ86W56 976 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 FAM174AQ8TBP5 190 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 RAPGEF5Q92565 580 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 GATA6Q92908 595 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 CENPTQ96BT3 561 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 FAF2Q96CS3 445 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 MGME1Q9BQP7 344 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 TFR2Q9UP52 801 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.33□□□□□ -0.6
DUXAP9-202ENST00000549484 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms