RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544989.1

HDAC4-216, Transcript of histone deacetylase 4, human

TSL 5

Gene HDAC4, Length 342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC4-216	ENST00000544989	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FATE1	Q969F0	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	CHP1	Q99653	195 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	RNF103	O00237	685 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	WNT9A	O14904	365 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MAFK	O60675	156 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SOCS5	O75159	536 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	KRT10	P13645	584 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TIMP2	P16035	220 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	IL4R	P24394	825 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	GJC1	P36383	396 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SCNN1B	P51168	640 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ARSE	P51690	589 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	YPEL5	P62699	121 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FOXC1	Q12948	553 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MESD	Q14696	234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	KLK6	Q92876	244 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989		H3BM21	787 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	KCNK3	O14649	394 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	INSIG1	O15503	277 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	NEBL	O76041	1014 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PIGN	O95427	931 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	C1S	P09871	688 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ALPPL2	P10696	532 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	CCNC	P24863	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MAGEA1	P43355	309 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MMP13	P45452	471 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF75D	P51815	510 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5	1e-10	■■■■■ 35.5
HDAC4-216	ENST00000544989	GALNT2	Q10471	571 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	AGER	Q15109	404 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989		Q6ZSR6	202 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PARG	Q86W56	976 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	VOPP1	Q96AW1	172 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MYOC	Q99972	504 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MATN3	O15232	486 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	SPOP	O43791	374 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	MMP20	O60882	483 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC4-216	ENST00000544989	LCA5L	O95447	670 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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