RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 LEFTY1O75610 366 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 PIGNO95427 931 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 IL1BP01584 269 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 UGT2B4P06133 528 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 MMP2P08253 660 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 PSMD8P48556 350 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 SKOR1P84550 965 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 MPP3Q13368 585 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 ARSIQ5FYB1 569 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 TMIEQ8NEW7 156 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 FAM129BQ96TA1 746 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM20-201ENST00000506197 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 HRO43593 1189 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH1A2O94788 518 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ADH1BP00325 375 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TERF1P54274 439 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SEMA5AQ13591 1074 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PCSK7Q16549 785 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 IPMKQ8NFU5 416 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 IFT43Q96FT9 208 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 DYRK4Q9NR20 520 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CTSLP07711 333 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 COPAP53621 1224 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 FOXK2Q01167 660 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TRAF2Q12933 501 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CACUL1Q86Y37 369 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TADA1Q96BN2 335 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ERP44Q9BS26 406 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 A0A1W2PQ67 120 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 NDC80O14777 642 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 DNTTP04053 509 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 APRTP07741 180 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 WNT3AP56704 352 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TUBB4BP68371 445 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SLC7A5Q01650 507 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CST6Q15828 149 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TEX35Q5T0J7 233 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 KDELC1Q6UW63 502 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CEP68Q76N32 757 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PCGF5Q86SE9 256 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PGBD3Q8N328 593 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SNF8Q96H20 258 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 FICDQ9BVA6 458 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 CD248Q9HCU0 757 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SARDHQ9UL12 918 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 SPTBN2O15020 2390 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SMIM20-201ENST00000506197 AP2A1O95782 977 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms