RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 GAGE1Q13065 139 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 GAGE4Q13068 117 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MYBPHQ13203 477 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SNTA1Q13424 505 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 EFNB3Q15768 340 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ESCO2Q56NI9 601 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 FBXO47Q5MNV8 452 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CHD1LQ86WJ1 897 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 AADATQ8N5Z0 425 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ANKRD44Q8N8A2 993 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 DNAAF1Q8NEP3 725 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM170AQ8WVE7 144 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 RUFY2Q8WXA3 655 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 HERVK_113Q902F9 699 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CCT6BQ92526 530 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SCMH1Q96GD3 660 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CSF3RQ99062 836 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 EYA3Q99504 573 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PPCSQ9HAB8 311 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 HSF4Q9ULV5 492 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CNPY2Q9Y2B0 182 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 NFS1Q9Y697 457 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 COMMD10Q9Y6G5 202 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 WDR81Q562E7 1941 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 EBAG9O00559 213 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 RGS11O94810 467 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ARL4CP56559 192 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SLC12A1Q13621 1099 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 XKR9Q5GH70 373 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 BBS12Q6ZW61 710 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 LURAP1LQ8IV03 231 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SH3KBP1Q96B97 665 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 RNF183Q96D59 192 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MTBPQ96DY7 904 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 BICD1Q96G01 975 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 HEMGNQ9BXL5 484 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 GGA3Q9NZ52 723 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SLC9A2Q9UBY0 812 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SUFUQ9UMX1 484 aa2.94□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 KLRF2D3W0D1 207 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 BMPR1BO00238 502 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 HSPA12AO43301 675 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ATP2C2O75185 946 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CH25HO95992 272 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CHRNDQ07001 517 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 DLG1Q12959 904 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 GRIK3Q13003 919 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC6Q16204 474 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CALCRLQ16602 461 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SMIM29Q86T20 159 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 NAGSQ8N159 534 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CPXM2Q8N436 756 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TRIB2Q92519 343 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 LRFN5Q96NI6 719 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 IL17FQ96PD4 163 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 OR1F2PQ96R84 312 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 EPYCQ99645 322 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 NUF2Q9BZD4 464 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM160Q9NX00 188 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 SAGE1Q9NXZ1 904 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.93□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 CPED1A4D0V7 1026 aa2.92□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 TULP2O00295 520 aa2.92□□□□□ -1.94
TRBVA-201ENST00000498804 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms