RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SFTPC	P11686	197 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR1	P32246	355 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RABIF	P47224	123 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	INHBC	P55103	352 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK17	Q00537	523 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SGCG	Q13326	291 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD2	Q14332	565 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SGF29	Q96ES7	293 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MED15	Q96RN5	788 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NEMP1	O14524	444 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD2	O14939	933 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSL	P07711	333 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA6	P08133	673 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOC	P08134	193 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SRC	P12931	536 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CMA1	P23946	247 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK3	P51956	506 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	THOP1	P52888	689 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTM4	Q03013	218 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CETN1	Q12798	172 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	UBR7	Q8N806	425 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	STRADB	Q9C0K7	418 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121B	A6NF01	834 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TPP1	O14773	563 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAP91	O60641	907 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN11	O75508	207 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ENDOD1	O94919	500 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-CO1	P00395	513 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM87A	P0C7U9	286 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD7	P0C870	316 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT5	P13647	590 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RRM1	P23921	792 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A2	P31639	672 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DNA2	P51530	1060 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NME3	Q13232	169 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf61	Q13536	156 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	BMF	Q96LC9	184 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.03	□□□□□ -0.64

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