RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478588.5

AFF4-208, Transcript of AF4/FMR2 family member 4, human

TSL 3

Gene AFF4, Length 897 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFF4-208	ENST00000478588	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588		B4DGG1	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588		F8W810	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	INSIG1	O15503	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ATG13	O75143	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	USP12	O75317	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TULP3	O75386	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	EPN2	O95208	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TOMM40	O96008	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	HOXC6	P09630	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SCP2	P22307	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MCC	P23508	829 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TERF1	P54274	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CBFB	Q13951	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	GRB14	Q14449	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TRIB2	Q92519	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PMM1	Q92871	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MECR	Q9BV79	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PORCN	Q9H237	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588		A6NNC1	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588		F5H6K3	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	NKX2-8	O15522	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ASNA1	O43681	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ZBED4	O75132	1171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CNTN5	O94779	1100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	GLP2R	O95838	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ALPL	P05186	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TPM2	P07951	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CHRNB1	P11230	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	NPPB	P16860	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SERPINB3	P29508	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	AKT1	P31749	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FOXL2	P58012	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TFAP4	Q01664	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	KLRC3	Q07444	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	KCTD2	Q14681	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ALX1	Q15699	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	USP6NL	Q92738	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FAR2	Q96K12	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AFF4-208	ENST00000478588	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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