RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 GPR27Q9NS67 375 aa13.16□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.16□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.16□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 SCINQ9Y6U3 715 aa13.16□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP42A6NI28 874 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 RFPL3O75679 317 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 PALMO75781 387 aa13.15□□□□□ -0.3
HPS1-211ENST00000478087 RARAP10276 462 aa13.15□□□□□ -0.3
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HPS1-211ENST00000478087 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.15□□□□□ -0.3
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HPS1-211ENST00000478087 CYP1A2P05177 515 aa13.14□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 MMRN1Q13201 1228 aa13.14□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.14□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 LCMT1Q9UIC8 334 aa13.14□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.14□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.13□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 HES3Q5TGS1 186 aa13.13□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PGBD5Q8N414 524 aa13.13□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ASB12Q8WXK4 309 aa13.13□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PACSIN1Q9BY11 444 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SP110Q9HB58 689 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NENFQ9UMX5 172 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 RAXQ9Y2V3 346 aa13.13□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TSPAN11A1L157 253 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 K7ESM1 405 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 AKR1B10O60218 316 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GCATO75600 419 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 C1SP09871 688 aa13.12□□□□□ -0.31
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