RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 COPG2Q9UBF2 871 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CLRN2A0PK11 232 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPBD1B2RD01 187 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ASNA1O43681 348 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ADORA2AP29274 412 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GNA15P30679 374 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN7P35236 360 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ROR1Q01973 937 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC13A2Q13183 592 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC38Q5VT99 294 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM270Q6UE05 265 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF677Q86XU0 584 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MPP5Q8N3R9 675 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NACC1Q96RE7 527 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TCF12Q99081 682 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SATB2Q9UPW6 733 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 E7ENX8 843 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BRB1 525 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IDH3BO43837 385 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCGP05129 697 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH1P12830 882 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MPSTP25325 297 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A1P30825 629 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA5P36382 358 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ACADSBP45954 432 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 OAZ1P54368 228 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PSME3P61289 254 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ECT2LQ008S8 904 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP6Q13520 282 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS12Q6ZW61 710 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NAT16Q8N8M0 369 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MTRRQ9UBK8 725 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FEM1BQ9UK73 627 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AURKCQ9UQB9 309 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SNPHO15079 494 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A4O15374 487 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FKTNO75072 461 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT3P12035 628 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT20P35900 424 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB9P50453 376 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GCNT1Q02742 428 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF5Q15542 800 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO11Q86XK2 927 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NATD1Q8N6N6 113 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIB2Q92519 343 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CNDP1Q96KN2 507 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RIT2Q99578 217 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LHPPQ9H008 270 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM159BA6NKW6 160 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K6O95382 1288 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNGP07510 517 aa8.45□□□□□ -1.06
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