RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 FUT10Q6P4F1 479 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HTR3DQ70Z44 454 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC15A4Q8N697 577 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRPV3Q8NET8 790 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR48Q8TAF3 677 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 C10orf82Q8WW14 230 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRC39Q96DD0 335 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ASB2Q96Q27 587 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC22A4Q9H015 551 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PIGUQ9H490 435 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NPHS2Q9NP85 383 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 COX16Q9P0S2 106 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NARFQ9UHQ1 456 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 VAV3Q9UKW4 847 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TMX2Q9Y320 296 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PAPPAQ13219 1627 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ATP8B3O60423 1300 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LTN1O94822 1766 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SBF2Q86WG5 1849 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 KLRF2D3W0D1 207 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 H3BNH8 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 EML1O00423 815 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRIM38O00635 465 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CST8O60676 142 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SOX30O94993 753 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CCNB2O95067 398 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CCNE2O96020 404 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 S100A8P05109 93 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CDK1P06493 297 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 FABP1P07148 127 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 THEGLP0DJG4 465 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GNSP15586 552 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CKMT2P17540 419 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ABCB4P21439 1286 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NR4A1P22736 598 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 POU1F1P28069 291 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HPCAL1P37235 193 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NR4A2P43354 598 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MAGEA1P43355 309 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GSTM5P46439 218 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ALDH1A3P47895 512 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNJ5P48544 419 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RGS19P49795 217 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NKX3-2P78367 333 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC39A6Q13433 755 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GCKRQ14397 625 aa6.25□□□□□ -1.41
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