RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH16O75309 829 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ECI2O75521 394 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GRM2Q14416 872 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.624e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RASA2Q15283 850 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 YAF2Q8IY57 180 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRAC1Q9NRG0 131 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS18Q9P253 973 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A3Q01955 1670 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MYLKQ15746 1914 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf42Q9H799 3197 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 NDST3O95803 873 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF1P05230 155 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1S1P61966 158 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 RUNX3Q13761 415 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 POU6F1Q14863 301 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD16Q68DU8 428 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CPA6Q8N4T0 437 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 LRCH3Q96II8 777 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 RANBP9Q96S59 729 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP44Q9C0F1 390 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 RAI2Q9Y5P3 530 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRA1DP25100 572 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1H3Q13133 447 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CES3Q6UWW8 571 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVW-1Q9UQF0 538 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CHKBQ9Y259 395 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM159BA6NKW6 160 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PIAS1O75925 651 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PRLP01236 227 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A11P48066 632 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAF2Q12933 501 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 C22orf39Q6P5X5 142 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MTSS1LQ765P7 747 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TLCD1Q96CP7 247 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD3Q96ES6 412 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PAFAH2Q99487 392 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SMYD2Q9NRG4 433 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF6O95976 241 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ALADP13716 330 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 NMBRP28336 390 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK8P45983 427 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 VASPP50552 380 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT3Q14435 633 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF449Q6P9G9 518 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.616e-6■■■■■ 47.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPRX3Q96LB0 322 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF778Q96MU6 729 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 DEC1Q9P2X7 70 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD6O60353 706 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GSRP00390 522 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GDI1P31150 447 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 DLG2Q15700 870 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.1■■□□□ 1.61
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