RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616429.1

U85056.1-201, humanhuman

BASIC

Gene U85056.1, Length 682 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U85056.1-201ENST00000616429 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ILKQ13418 452 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 RFX8Q6ZV50 586 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CENPTQ96BT3 561 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DAPK3O43293 454 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PRPSAP2O60256 369 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 LRCH4O75427 683 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NEBLO76041 1014 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CSF2P04141 144 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ERCC2P18074 760 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HNF1BP35680 557 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 RGRP47804 291 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 FANCCQ00597 558 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 FIGNQ5HY92 759 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 AFMIDQ63HM1 303 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HGSNATQ68CP4 663 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 VPS36Q86VN1 386 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ISCUQ9H1K1 167 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.75■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PKD1L2Q7Z442 2459 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 IGFALSP35858 605 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PBX1P40424 430 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DAB2P98082 770 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PARGQ86W56 976 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TP53INP2Q8IXH6 220 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NPWQ8N729 165 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DONSONQ9NYP3 566 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 LHX6Q9UPM6 363 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 SCINQ9Y6U3 715 aa24.74■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 SCAMP1O15126 338 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TM7SF2O76062 418 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NME1P15531 152 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TCF4P15884 667 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 IL1R2P27930 398 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HS1BP3Q53T59 392 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 APOLD1Q96LR9 279 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NLGN3Q9NZ94 848 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.73■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 K7ESM1 405 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DFFAO00273 331 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CKMT1AP12532 417 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TMEM52BQ4KMG9 183 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ZSWIM9Q86XI8 627 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 RFFLQ8WZ73 363 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TRIM11Q96F44 468 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 U3KQA8 63 aa24.72■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TSPAN11A1L157 253 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 NEMP2A6NFY4 417 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PALMO75781 387 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 MYBL1P10243 752 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 ALPPL2P10696 532 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 JUNDP17535 347 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HCAR3P49019 387 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 SEMG2Q02383 582 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 DPYSQ14117 519 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 UGP2Q16851 508 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 SRLQ86TD4 932 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 RBFAQ8N0V3 343 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.71■■□□□ 1.55
U85056.1-201ENST00000616429 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms