RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC53	A6NM62	1247 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	NEMP1	O14524	444 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	TSPAN6	O43657	245 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	OPA1	O60313	960 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	CSF2	P04141	144 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	PRB1	P04280	392 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	MPO	P05164	745 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	TPM2	P07951	284 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	TCF4	P15884	667 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	JUND	P17535	347 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	TGM2	P21980	687 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	ILK	Q13418	452 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	SERINC3	Q13530	473 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	IRF4	Q15306	451 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	CDKN3	Q16667	212 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	NPW	Q8N729	165 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	IFI44	Q8TCB0	444 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	LMX1A	Q8TE12	382 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	EPAS1	Q99814	870 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC61	Q9BV99	259 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	CLPB	Q9H078	707 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC19	Q9H756	370 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		15.02	■□□□□ -0
FCHO1-231	ENST00000600201	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		15.02	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	WASH4P	A8MWX3	477 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	FPGT	O14772	594 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	MUSK	O15146	869 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	AQP9	O43315	295 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	IGSF6	O95976	241 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ETFB	P38117	255 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RABIF	P47224	123 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	MAMLD1	Q13495	774 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TTC7B	Q86TV6	843 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CNPY3	Q9BT09	278 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CPED1	A4D0V7	1026 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CS	O75390	466 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	FER	P16591	822 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PSMA2	P25787	234 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ABCG1	P45844	678 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TPI1	P60174	286 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SGCG	Q13326	291 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PELI3	Q8N2H9	469 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB7B	Q96AH8	199 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	IFT43	Q96FT9	208 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM51	Q9NW97	253 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ATM	Q13315	3056 aa		15	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TM7SF2	O76062	418 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SKIL	P12757	684 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	GM2A	P17900	193 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFAIP3	P21580	790 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RALGDS	Q12967	914 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01

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