RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 F5H423 210 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 G3V2L1 256 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PEX11AO75192 247 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 USP12O75317 370 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TADA2AO75478 443 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 DDHD2O94830 711 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ANP32DO95626 131 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PEX11BO96011 259 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 EPOP01588 193 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IGLV3-27P01718 113 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ITGB1P05556 798 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SELPP16109 830 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 GNAZP19086 355 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 FGFR3P22607 806 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 YY1P25490 414 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 YWHAQP27348 245 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NMBRP28336 390 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IDH3AP50213 366 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 RABGGTBP53611 331 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PRMT2P55345 433 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 POU4F1Q01851 419 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IL10RBQ08334 325 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 GPR17Q13304 367 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TUBB3Q13509 450 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 BFSP2Q13515 415 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGEF6Q15052 776 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PPM1JQ5JR12 505 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 KDELC1Q6UW63 502 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CES3Q6UWW8 571 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IPMKQ8NFU5 416 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 HASPINQ8TF76 798 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 STYXQ8WUJ0 223 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TADA1Q96BN2 335 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC126Q96EE4 140 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 MFSD3Q96ES6 412 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 RILPQ96NA2 401 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF599Q96NL3 588 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 AGAP2Q99490 1192 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SORT1Q99523 831 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 FICDQ9BVA6 458 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CDH19Q9H159 772 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NMUR1Q9HB89 426 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 BATF3Q9NR55 127 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 OXSMQ9NWU1 459 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 STOML1Q9UBI4 398 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ACOT9Q9Y305 439 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 A8MUI8 341 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 B2RBV5 119 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ARVCFO00192 962 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF195O14628 629 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC7A4O43246 635 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 ITM2AO43736 263 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 TBC1D4O60343 1298 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 NPHS1O60500 1241 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-208ENST00000587914 CIB2O75838 187 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms