RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	RAD51B	O15315	384 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ANXA6	P08133	673 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PSMA2	P25787	234 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ABL2	P42684	1182 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NDST2	P52849	883 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CLDN6	P56747	220 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PFN3	P60673	137 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	FGL2	Q14314	439 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NAT6	Q93015	286 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TBATA	Q96M53	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	AREL1	O15033	823 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MMP20	O60882	483 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NFKBIA	P25963	317 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PEX5	P50542	639 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PPARD	Q03181	441 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ACAP1	Q15027	740 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC14	Q15048	493 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NR0B2	Q15466	257 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BROX	Q5VW32	411 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ITM2B	Q9Y287	266 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BRINP1	O60477	761 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PALM	O75781	387 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NEBL	O76041	1014 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ALPI	P09923	528 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CTSE	P14091	401 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SERPINA4	P29622	427 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TPM4	P67936	248 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TYRO3	Q06418	890 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ELOC	Q15369	112 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ASIC2	Q16515	512 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CDKN3	Q16667	212 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LGMN	Q99538	433 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SP110	Q9HB58	689 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	USP12	O75317	370 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GZMA	P12544	262 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TIMP2	P16035	220 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CSNK1D	P48730	415 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RENBP	P51606	427 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19

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