RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		U3KQA8	63 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		B8ZZF3	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR4	O00206	839 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	AGRP	O00253	132 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CAPN9	O14815	690 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTLC2	O15270	562 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	FFAR2	O15552	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	LAT	O43561	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC28A2	O43868	658 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RTN2	O75298	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBED1	O96006	694 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	WNT11	O96014	354 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MT-CO3	P00414	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	C1S	P09871	688 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	P4HA1	P13674	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PRLR	P16471	622 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CKMT2	P17540	419 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ACP1	P24666	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC8A1	P32418	973 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ACTN2	P35609	894 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RXRG	P48443	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IRAK1	P51617	712 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CCR5	P51681	352 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	AP3M2	P53677	418 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	DAOA	P59103	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IKZF1	Q13422	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	STK38	Q15208	465 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF4B	Q92750	862 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	KLK6	Q92876	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	EPN3	Q9H201	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		U3KQE9	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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