RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 KRT34O76011 436 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 PIK3R1P27986 724 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF460Q14592 562 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 HERC3Q15034 1050 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 PCSK7Q16549 785 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 RNF180Q86T96 592 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 AGR3Q8TD06 166 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 OMDQ99983 421 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 SP110Q9HB58 689 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 CDYLQ9Y232 598 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 DRGXA6NNA5 263 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 PGGT1BP53609 377 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 USP46P62068 366 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 SLC14A2Q15849 920 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC126Q96EE4 140 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 OR6C75A6NL08 312 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 J3KR12 359 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 TADA2AO75478 443 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 MMP2P08253 660 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 YWHAQP27348 245 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 ACLYP53396 1101 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 EPHB1P54762 984 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 MTTPP55157 894 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 EFEMP1Q12805 493 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 CNSTQ6PJW8 725 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-207ENST00000565975 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.52■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 SLC7A4O43246 635 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 COL6A1P12109 1028 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CDC25CP30307 473 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 GRK4P32298 578 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CD86P42081 329 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CCR10P46092 362 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 IL10RBQ08334 325 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CCNIQ14094 377 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 ALFQ53S48 1182 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 COMMD8Q9NX08 183 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CNTN5O94779 1100 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 EPHA3P29320 983 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 PFKPQ01813 784 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 ITKQ08881 620 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MTA1Q13330 715 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 MBTPS1Q14703 1052 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 PSMD5Q16401 504 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 C16orf89Q6UX73 402 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 KDM1BQ8NB78 822 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 FBXO32Q969P5 355 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 TTC1Q99614 292 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 NUF2Q9BZD4 464 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 WBP1LQ9NX94 342 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-207ENST00000565975 POMPQ9Y244 141 aa22.5■■□□□ 1.19
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