RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 PEBP4Q96S96 227 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 CBX8Q9HC52 389 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 LHX3Q9UBR4 397 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 J3KR12 359 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 INSIG1O15503 277 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 SPINT1O43278 529 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PRAMEF11O60813 436 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 MMP20O60882 483 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 ALPPL2P10696 532 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 TIMP2P16035 220 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 ACP1P24666 158 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 CLDN6P56747 220 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 FANCCQ00597 558 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 CYP4F3Q08477 520 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 FZD2Q14332 565 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 GRM3Q14832 879 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 RFX8Q6ZV50 586 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 LUZP1Q86V48 1076 aa22.74■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 ISCUQ9H1K1 167 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 GPR27Q9NS67 375 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 DKK4Q9UBT3 224 aa22.74■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 SUOXP51687 545 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 HES3Q5TGS1 186 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PARGQ86W56 976 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 CENPTQ96BT3 561 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.73■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 H3BM21 787 aa22.72■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 LRCH4O75427 683 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PALMO75781 387 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 CSF2P04141 144 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 ITIH2P19823 946 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 ELP6Q0PNE2 266 aa22.71■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 SP110Q9HB58 689 aa22.71■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 UGP2Q16851 508 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.7■■□□□ 1.22
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CLN3-215ENST00000565236 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.7■■□□□ 1.22
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CLN3-215ENST00000565236 CKMT1AP12532 417 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 JUNDP17535 347 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 PBX1P40424 430 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 CSNK1DP48730 415 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 YPEL5P62699 121 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 BOLA3Q53S33 107 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 ERAP2Q6P179 960 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN3-215ENST00000565236 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.69■■□□□ 1.22
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