RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DMD	P11532	3685 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DFFA	O00273	331 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FCHO1	O14526	889 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PFDN6	O15212	129 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	GSC2	O15499	205 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TBX10	O75333	385 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LATS1	O95835	1130 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RBP1	P09455	135 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNA4	P22459	653 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINB3	P29508	390 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1G1	P47890	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CLCN5	P51795	746 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJB13	P59910	316 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ2	P63252	427 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	IRX4	P78413	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PPARD	Q03181	441 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LIPM	Q5VYY2	423 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	KLC3	Q6P597	504 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CASP10	Q92851	521 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RILP	Q96NA2	401 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ACACB	O00763	2458 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1W2PQH9	124 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ENPP3	O14638	875 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NPHS1	O60500	1241 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	GSR	P00390	522 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	C2	P06681	752 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	STMN1	P16949	149 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CTNNB1	P35222	781 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CD151	P48509	253 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	AQP5	P55064	265 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB10	P61026	200 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SERINC3	Q13530	473 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PCLAF	Q15004	111 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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