RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ECT2LQ008S8 904 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 RUNX3Q13761 415 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC1A5Q15758 541 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 LONRF1Q17RB8 773 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CASC4Q6P4E1 433 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIB3Q96RU7 358 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 BFARQ9NZS9 450 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLCO1A2P46721 670 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 DMC1Q14565 340 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 28.2
PACSIN3-209ENST00000532457 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF778Q96MU6 729 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CHKBQ9Y259 395 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ARNTLO00327 626 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PDHA1P08559 390 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TSHRP16473 764 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GKP32189 559 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CDK18Q07002 472 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TTMPQ5BVD1 217 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 STEAP4Q687X5 459 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SRLQ86TD4 932 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 AHI1Q8N157 1196 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TLDC2A0PJX2 215 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ANTXRLA6NF34 631 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM23A6NLE4 172 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PRRT4C9JH25 899 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GJA4P35212 333 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 OPRD1P41143 372 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 POU6F1Q14863 301 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO19Q96H55 970 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 FEM1CQ96JP0 617 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM14Q96QK8 99 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 RUFY1Q96T51 708 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 COL4A3Q01955 1670 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CES1P23141 567 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TRAF2Q12933 501 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GALNT3Q14435 633 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 DLG2Q15700 870 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPRNQ16849 979 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CD320Q9NPF0 282 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TCEA3O75764 348 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 EPOP01588 193 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SULT2A1Q06520 285 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 STAT4Q14765 748 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC14A2Q15849 920 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT71Q3SY84 523 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM135Q86UB9 458 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MFSD3Q96ES6 412 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 IL22Q9GZX6 179 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MYLKQ15746 1914 aa22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC78A2IDD5 438 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RASGRF2O14827 1237 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKCGP05129 697 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PGAM1P18669 254 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 NMBRP28336 390 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPRRQ15256 657 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 IFT43Q96FT9 208 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KIFC1Q9BW19 673 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 DEC1Q9P2X7 70 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.14■■□□□ 1.13
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