RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MPLP40238 635 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GABRB2P47870 512 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NEK3P51956 506 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF7Q14155 803 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RAPGEF5Q92565 580 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NUP205Q92621 2012 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 E7EVH7 732 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 APOL1O14791 398 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RASGRP1O95267 797 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PIGNO95427 931 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM253P0C7T8 217 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CD6P30203 668 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 L1CAMP32004 1257 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 METAP1P53582 386 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 IRX4P78413 519 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXK2Q01167 660 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL2L1Q07817 233 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MTM1Q13496 603 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TLR1Q15399 786 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DOK6Q6PKX4 331 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NPNTQ6UXI9 565 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PEBP4Q96S96 227 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LGMNQ99538 433 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SERTM1A2A2V5 107 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PRNPP04156 253 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ACOX1Q15067 660 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SARM1Q6SZW1 724 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDN23Q96B33 292 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SKA1Q96BD8 255 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MFSD3Q96ES6 412 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FEM1CQ96JP0 617 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 APOL2Q9BQE5 337 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ISCUQ9H1K1 167 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCG8Q9H221 673 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FZD10Q9ULW2 581 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ITM2BQ9Y287 266 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ILVBLA1L0T0 632 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 C4orf47A7E2U8 309 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 I6L893 689 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FFAR2O15552 330 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CELA3AP09093 270 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CISD3P0C7P0 127 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SRCP12931 536 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PBX1P40424 430 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GBE1Q04446 702 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTN1Q12860 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MTA1Q13330 715 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NNTQ13423 1086 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MEA1Q16626 185 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SEMA3CQ99985 751 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 IGF2RP11717 2491 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms