RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF385BQ569K4 471 aa2.34□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa2.34□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ITSN1Q15811 1721 aa2.34□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 IFT172Q9UG01 1749 aa2.34□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC72A6NJI9 287 aa2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 MOSPD3O75425 235 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A12O75746 678 aa2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM68Q96MH6 324 aa2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.33□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 SMOC2Q9H3U7 446 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GDE1Q9NZC3 331 aa2.33□□□□□ -2.04
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