RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 DENND6BQ8NEG7 585 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB3-211ENST00000490677 EXOC2Q96KP1 924 aa28.16■■■□□ 2.1
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC39A8Q9C0K1 460 aa28.16■■■□□ 2.1
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HOXB3-211ENST00000490677 PCSK1NQ9UHG2 260 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB3-211ENST00000490677 U3KQA8 63 aa28.16■■■□□ 2.1
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HOXB3-211ENST00000490677 LRCH4O75427 683 aa28.14■■■□□ 2.1
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HOXB3-211ENST00000490677 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 NLGN3Q9NZ94 848 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 NEMP1O14524 444 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 MMP20O60882 483 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 JUPP14923 745 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 ERCC2P18074 760 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 DESP17661 470 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 IL1R2P27930 398 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 HNF1BP35680 557 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 APOLD1Q96LR9 279 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 NSMCE3Q96MG7 304 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 LHX6Q9UPM6 363 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 SYCE3A1L190 88 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 K7ESM1 405 aa28.1■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 HCAR3P49019 387 aa28.1■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 SUV39H2Q9H5I1 410 aa28.1■■■□□ 2.09
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HOXB3-211ENST00000490677 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 VPS36Q86VN1 386 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 SCINQ9Y6U3 715 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQJ5 194 aa28.08■■■□□ 2.09
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