RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAPBO95292 243 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH2P05091 517 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2P06681 752 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLNP12872 115 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD10P28358 340 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACVRL1P37023 503 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBB3Q13509 450 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRRQ15256 657 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPCAT4Q643R3 524 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MKS1Q9NXB0 559 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A088AWK7 358 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF487B1APH4 448 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AIM2O14862 343 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1BP01584 269 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMP1P13497 986 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPSTP25325 297 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC11Q96DB2 347 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT43Q96FT9 208 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52B2Q96RD2 323 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OMDQ99983 421 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.68■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR11A4FU01 709 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFLARO15519 480 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEC1O60732 1142 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJB5O95377 273 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-25P01717 112 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHA3P29320 983 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1D2P34982 312 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP2B1P63010 937 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSC2Q02487 901 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARTNQ5T4W7 220 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAT14Q8WUY8 206 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBBP8Q99708 897 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD3Q9Y597 815 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR51F1A6NGY5 319 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN3O60637 253 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAP1GDS1P52306 607 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNGA3Q16281 694 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL22Q6P050 247 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIC2Q96JB3 615 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPNE1Q99829 537 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.67■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB14O43829 449 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OAZ2O95190 189 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EOMESO95936 686 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLDCP23378 1020 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YWHAQP27348 245 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD86P42081 329 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTR3P61158 418 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM3Q14832 879 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APBB2Q92870 758 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WBP2Q969T9 261 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUF2Q9BZD4 464 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NACA2Q9H009 215 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VCX3BQ9H321 246 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0D9SEW6 157 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNDC9O14530 226 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN15O75808 1086 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOMM70O94826 608 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALTP07902 379 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATF6P18850 670 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms