RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-210	ENST00000481348	TM7SF2	O76062	418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ALPPL2	P10696	532 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	TIMP2	P16035	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	MIP	P30301	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	DAB2	P98082	770 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	FANCC	Q00597	558 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	FZD2	Q14332	565 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348		H3BM21	787 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SCAMP1	O15126	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	INSIG1	O15503	277 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	MMP20	O60882	483 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PALM	O75781	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CSF2	P04141	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ERCC2	P18074	760 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SUOX	P51687	545 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	UBASH3A	P57075	661 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PFN3	P60673	137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	E2F1	Q01094	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ACAP1	Q15027	740 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PARG	Q86W56	976 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SPEG	Q15772	3267 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	LRCH4	O75427	683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PIGN	O95427	931 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ITIH2	P19823	946 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	PCK1	P35558	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	HCAR3	P49019	387 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CLDN6	P56747	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	UGP2	Q16851	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	SP110	Q9HB58	689 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	MYLK	Q15746	1914 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ABCD4-210	ENST00000481348	KNTC1	P50748	2209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348		K7ESM1	405 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	DFFA	O00273	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	TOR1B	O14657	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	NEBL	O76041	1014 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	SERPING1	P05155	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	CKMT1A	P12532	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	JUND	P17535	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	IGFALS	P35858	605 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	PBX1	P40424	430 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	CSNK1D	P48730	415 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	THOP1	P52888	689 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	YPEL5	P62699	121 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-210	ENST00000481348	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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