RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.214e-9■□□□□ 8.7
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NISCH-207ENST00000479054 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 OPTCQ9UBM4 332 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 SLC10A3P09131 477 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-207ENST00000479054 CD86P42081 329 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 PTPN9P43378 593 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 GBE1Q04446 702 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 NR6A1Q15406 480 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-207ENST00000479054 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.72□□□□□ -0.21
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