RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 FYNP06241 537 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ATP6V1B2P21281 511 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ARNTP27540 789 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MAGEA8P43361 318 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 TPI1P60174 286 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PRAMEP78395 509 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ZBED5Q49AG3 693 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 LAYNQ6UX15 382 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ERMP1Q7Z2K6 904 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 BEST2Q8NFU1 509 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 TEKT5Q96M29 485 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 STAP1Q9ULZ2 295 aa10.44□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MRASO14807 208 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 AKAP10O43572 662 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CNMDO75829 334 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 LGALS2P05162 132 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 KCNA5P22460 613 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 GALNT2Q10471 571 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PPIL2Q13356 520 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 UGP2Q16851 508 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 DHFR2Q86XF0 187 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CROTQ9UKG9 612 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CDC14AQ9UNH5 594 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 A0A087WXM4 84 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CLDN5O00501 218 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MTSS1O43312 755 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MYF6P23409 242 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 GRIA3P42263 894 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 POLD2P49005 469 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SLC7A2P52569 658 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 TAS2R39P59534 338 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SCAPQ12770 1279 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 OR2T34Q8NGX1 318 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 OR2T3Q8NH03 318 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 TCF12Q99081 682 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP16Q9BY84 665 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SNX25Q9H3E2 840 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 MRGBPQ9NV56 204 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 CDH7Q9ULB5 785 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 OTOFQ9HC10 1997 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PIRO00625 290 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 NRP2O60462 931 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 JCHAINP01591 159 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 LRPAP1P30533 357 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SLC1A2P43004 574 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PSMD5Q16401 504 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF280DQ6N043 979 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ALKAL1Q6UXT8 129 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF786Q8N393 782 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 NTAN1Q96AB6 310 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SLC9A7Q96T83 725 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 VAT1Q99536 393 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.43□□□□□ -0.74
LINC00886-201ENST00000472943 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms