RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SGF29Q96ES7 293 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TEKT5Q96M29 485 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ACOT9Q9Y305 439 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NRCAMQ92823 1304 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PLXNB2O15031 1838 aa6.66□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 A8MT66 165 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CLDN5O00501 218 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PIRO00625 290 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MRASO14807 208 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 AKAP10O43572 662 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CACNG3O60359 315 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ATP6V1G1O75348 118 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RECQL4O94761 1208 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 UGT1A6P19224 532 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC7A2P52569 658 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TPI1P60174 286 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PFKPQ01813 784 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PSMD5Q16401 504 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 AGKQ53H12 422 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RETREG3Q86VR2 466 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC9A7Q96T83 725 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MUC3BQ9H195 1237 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NEU3Q9UQ49 428 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 COL1A2P08123 1366 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FXYD1O00168 92 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NME4O00746 187 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NCAM2O15394 837 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 STMN1P16949 149 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NPR3P17342 541 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MYF6P23409 242 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 YWHAQP27348 245 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LRPAP1P30533 357 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RABGGTBP53611 331 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PRKCQQ04759 706 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 STX5Q13190 355 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MAPRE2Q15555 327 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.65□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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