RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 DEC1Q9P2X7 70 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf81A6NN90 581 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ATP9BO43861 1147 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SNAP91O60641 907 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 PSMA3P25788 255 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CD70P32970 193 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 VIPR2P41587 438 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MAXP61244 160 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ST8SIA6P61647 398 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 BCL2L1Q07817 233 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 RUNX3Q13761 415 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MYLK3Q32MK0 819 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CARD16Q5EG05 197 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MBLAC2Q68D91 279 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 STYXQ8WUJ0 223 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ARL8AQ96BM9 186 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP36Q96G28 342 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SGSM3Q96HU1 749 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CENPHQ9H3R5 247 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 UBP1Q9NZI7 540 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 LHX3Q9UBR4 397 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SUN2Q9UH99 717 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CD207Q9UJ71 328 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MROH6A6NGR9 719 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 WASH3PC4AMC7 463 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 PFDN6O15212 129 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01565O15544 149 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A4O43246 635 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SIN3BO75182 1162 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CYP17A1P05093 508 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SRCP12931 536 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KRT15P19012 456 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 GLDCP23378 1020 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINA4P29622 427 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SUOXP51687 545 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 PPP2R2AP63151 447 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CRYMQ14894 314 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT7Q86SF2 657 aa9.69□□□□□ -0.86
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HDLBP-211ENST00000425989 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 MPP5Q8N3R9 675 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 SUSD6Q92537 303 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CENPTQ96BT3 561 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CERS2Q96G23 380 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 TRIB3Q96RU7 358 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE1Q99829 537 aa9.69□□□□□ -0.86
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