RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BEND5Q7L4P6 421 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STRADAQ7RTN6 431 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MREGQ8N565 214 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRGQQ8WZA9 623 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYLPFQ96A32 169 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATA17Q96L03 361 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED10Q9BTT4 135 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT82Q9NSB4 513 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CENPEQ02224 2701 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIK3R2O00459 728 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COCHO43405 550 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OPA1O60313 960 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGB2P05107 769 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV4-34P06331 123 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BDNFP23560 247 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOS2P35228 1153 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HDAC4P56524 1084 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP3K7CLP57077 242 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADIGQ0VDE8 80 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDK2Q15119 407 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PROX2Q3B8N5 592 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BBS12Q6ZW61 710 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC13Q8NBP0 860 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATL2Q8NHH9 583 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM172AQ8WUF8 416 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SGF29Q96ES7 293 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEBP4Q96S96 227 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLK2Q9NYY3 685 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OGFRQ9NZT2 677 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLAAQ9Y263 795 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP3Q9Y6I4 520 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLXNA2O75051 1894 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ESYT3A0FGR9 886 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRD1A4D1F6 860 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM38O00635 465 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WNT9AO14904 365 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAPK3O43293 454 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLEC6O43699 453 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIASO43766 372 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRPSAP2O60256 369 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDC3O75056 442 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRAP2O75791 330 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ECEL1O95672 775 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCP1P13796 627 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRKCHP24723 683 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GJC1P36383 396 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEA11P43364 429 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TKTL1P51854 596 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CACNA2D1P54289 1103 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAOAP59103 153 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAB2P98082 770 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADCY2Q08462 1091 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTK6Q13882 451 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRADDQ15628 312 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBR1Q16650 682 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAF2Q96CS3 445 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPY6RQ99463 290 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms