RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CDKL2	Q92772	493 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	VAPB	O95292	243 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC4A1	P02730	911 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP17A1	P05093	508 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	BRAF	P15056	766 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TCF3	P15923	654 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	EML3	Q32P44	896 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SPAG7	O75391	227 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PAPLN	O95428	1278 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ADH5	P11766	374 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	KRT4	P19013	534 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ADRA1D	P25100	572 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIO	O75962	3097 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CCL22	O00626	93 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	BMP1	P13497	986 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MGAT5	Q09328	741 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	GRM2	Q14416	872 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MYADM	Q96S97	322 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	MYLK	Q15746	1914 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	NDST3	O95803	873 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ADH1C	P00326	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SRC	P12931	536 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC8A1	P32418	973 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PLK1	P53350	603 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	TRAF2	Q12933	501 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPRR	Q15256	657 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	CYS1	Q717R9	158 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RAD9B-204	ENST00000409300	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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