RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384631.1

RNU6-178P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 178, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-178P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-178P-201ENST00000384631 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-178P-201ENST00000384631 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-178P-201ENST00000384631 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-178P-201ENST00000384631 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 A0A087WZY1 265 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 OR6C75A6NL08 312 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 LRRC53A6NM62 1247 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TMEM233B4DJY2 109 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 H3BM21 787 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 WRBO00258 174 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PLK4O00444 970 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC30A4O14863 429 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TEX28O15482 410 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 LRRTM2O43300 516 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ST18O60284 1047 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PCDH8O95206 1070 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GBAP04062 536 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 CTSBP07858 339 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ATF2P15336 505 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TIMP2P16035 220 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 FUT1P19526 365 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ACP1P24666 158 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PRDX5P30044 214 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 CTNNB1P35222 781 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TRIM23P36406 574 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 KCNJ1P48048 391 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 KCNJ4P48050 445 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC6A11P48066 632 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 POU3F4P49335 361 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 CDK7P50613 346 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 UCP2P55851 309 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ST8SIA6P61647 398 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PTH1RQ03431 593 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TLE1Q04724 770 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PPIL2Q13356 520 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 OLIG2Q13516 323 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GRAPQ13588 217 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GRM4Q14833 912 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 AFMIDQ63HM1 303 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 LDHDQ86WU2 507 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 NME9Q86XW9 330 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TC2NQ8N9U0 490 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SMYD1Q8NB12 490 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 OR52J3Q8NH60 311 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 APBB2Q92870 758 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC35B4Q969S0 331 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GAD1Q99259 594 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TSG101Q99816 390 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 VCX2Q9H322 139 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 TREM1Q9NP99 234 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 PKD2L1Q9P0L9 805 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 VPS51Q9UID3 782 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 NENFQ9UMX5 172 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-178P-201ENST00000384631 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms