RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372003.5

TSPAN1-201, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-201ENST00000372003 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PRKAA2P54646 552 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 NR1H2P55055 460 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 HPCAP84074 193 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 APOFQ13790 326 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 KCNC3Q14003 757 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MYBPC3Q14896 1274 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 HERC3Q15034 1050 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 EPGNQ6UW88 154 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 NPNTQ6UXI9 565 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 EMC1Q8N766 993 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CASP10Q92851 521 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GALNT8Q9NY28 637 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MID2Q9UJV3 735 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FBXW11Q9UKB1 542 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TRANK1O15050 2925 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 HACD1B0YJ81 288 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TXNDC9O14530 226 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 UGT1A9O60656 530 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 DNAJA2O60884 412 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FBXO21O94952 628 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PYGLP06737 847 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SETSIPP0DME0 302 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 RALBP11234 206 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 IL4RP24394 825 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GPD2P43304 727 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 HDAC4P56524 1084 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SMARCB1Q12824 385 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 KLF10Q13118 480 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MMRN1Q13201 1228 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MTM1Q13496 603 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TLR1Q15399 786 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 STILQ15468 1287 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TAF5Q15542 800 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CNGA3Q16281 694 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PACS1Q6VY07 963 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MAVSQ7Z434 540 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PQLC3Q8N755 202 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 LRGUKQ96M69 825 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 HAUS8Q9BT25 410 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CDH19Q9H159 772 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MRGBPQ9NV56 204 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CLEC1BQ9P126 229 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 COPG2Q9UBF2 871 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 DPP7Q9UHL4 492 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 VWA8A3KMH1 1905 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MYO9BQ13459 2157 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 CCL16O15467 120 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PDE5AO76074 875 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MICAL2O94851 1124 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 LRG1P02750 347 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 ETS2P15036 469 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 KCNA5P22460 613 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GLDCP23378 1020 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PMLP29590 882 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 LTBRP36941 435 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GRIK1P39086 918 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 MAGEA12P43365 314 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GPR15P49685 360 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SNX16P57768 344 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TWF1Q12792 350 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 DDR2Q16832 855 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 GRTP1Q5TC63 336 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN1-201ENST00000372003 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms