RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368636.8

BNIP3-201, Transcript of BCL2 interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BNIP3, Length 2,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3-201ENST00000368636 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 TMEM247A6NEH6 219 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 PGK1P00558 417 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 AHSGP02765 367 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 ARL4AP40617 200 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 CBLBQ13191 982 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 DPYSQ14117 519 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 PERM1Q5SV97 790 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 REPS2Q8NFH8 660 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.65□□□□□ -0.06
BNIP3-201ENST00000368636 A0A087WXM4 84 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 EI24O14681 340 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MRASO14807 208 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 TRIM24O15164 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 BMP10O95393 424 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MLNP12872 115 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 LRPAP1P30533 357 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 EFNA5P52803 228 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 RETREG3Q86VR2 466 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 DHFR2Q86XF0 187 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 POMKQ9H5K3 350 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 USP3Q9Y6I4 520 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SQORQ9Y6N5 450 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 CBFA2T3O75081 653 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 GSTT2P0CG29 244 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 GSTT2BP0CG30 244 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ELK4P28324 431 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SLC7A1P30825 629 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 HUNKP57058 714 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MERTKQ12866 999 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 CNTD1Q8N815 330 aa14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 TOR1BO14657 336 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 NCK1P16333 377 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 APLP1P51693 650 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PIGFQ07326 219 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 STXBP2Q15833 593 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 TMEM135Q86UB9 458 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 BFARQ9NZS9 450 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 USP22Q9UPT9 525 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ACKR2O00590 384 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 DDHD2O94830 711 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 IL18RAPO95256 599 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 SNAP29O95721 258 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PROZP22891 400 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 NR2C2P49116 596 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 POU6F1Q14863 301 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PARP8Q8N3A8 854 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 BORCS5Q969J3 196 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 VPS45Q9NRW7 570 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 GINS2Q9Y248 185 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 UBDO15205 165 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 CLOCKO15516 846 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ARIH2O95376 493 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 MPOP05164 745 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 TUBA4AP68366 448 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 CARTPTQ16568 116 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 ANO4Q32M45 955 aa14.63□□□□□ -0.07
BNIP3-201ENST00000368636 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms