RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 PTPRNQ16849 979 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ALS2CLQ60I27 953 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 UNC5AQ6ZN44 842 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 OR2AP1Q8NGE2 309 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LRRC39Q96DD0 335 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SMIM14Q96QK8 99 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 KCNK12Q9HB15 430 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NFS1Q9Y697 457 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MIA3Q5JRA6 1907 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 AGPSO00116 658 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ATP8B1O43520 1251 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PDHA1P08559 390 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NPY2RP49146 381 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 AP1S1P61966 158 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GPR153Q6NV75 609 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CAMK1DQ8IU85 385 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PAF1Q8N7H5 531 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TRIB3Q96RU7 358 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.95■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 KAT7O95251 611 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ASLP04424 464 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NUDT17P0C025 328 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PGAM1P18669 254 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CES1P23141 567 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLCO1A2P46721 670 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CHST14Q8NCH0 376 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FBF1Q8TES7 1133 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 RMDN1Q96DB5 314 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ERLEC1Q96DZ1 483 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MYO19Q96H55 970 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MYLKQ15746 1914 aa17.94■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NDST3O95803 873 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GSRP00390 522 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ABHD2P08910 425 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 HLA-EP13747 358 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PHBP35232 272 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NNMTP40261 264 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ST8SIA6P61647 398 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PTPRRQ15256 657 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC14A2Q15849 920 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LONRF1Q17RB8 773 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CARD16Q5EG05 197 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LRIG3Q6UXM1 1119 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 UNC5BQ8IZJ1 945 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC44A3Q8N4M1 653 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CEP44Q9C0F1 390 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 IL22Q9GZX6 179 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CENPHQ9H3R5 247 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CHRAC1Q9NRG0 131 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TLDC2A0PJX2 215 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PRLP01236 227 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 IL9P15248 144 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 HLA-DPA1P20036 260 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 BCL2L1Q07817 233 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CBLBQ13191 982 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CRYMQ14894 314 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MYLK3Q32MK0 819 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MICALCLQ6ZW33 695 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FRS2Q8WU20 508 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ARNT2Q9HBZ2 717 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa17.93■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 AP3B1O00203 1094 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NARSO43776 548 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC4A1P02730 911 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 APODP05090 189 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms