RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RAB7BQ96AH8 199 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC2Q96KP1 924 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PANX2Q96RD6 677 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 THAP2Q9H0W7 228 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC19Q9H756 370 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PDFQ9HBH1 243 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 LHX3Q9UBR4 397 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ITM2BQ9Y287 266 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 MYLKQ15746 1914 aa7.77□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 A6NNZ2 444 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 J3KR12 359 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 DFFAO00273 331 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SPINT1O43278 529 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF14O43557 240 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN6O43657 245 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF11O60813 436 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ITGAVP06756 1048 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PROS1P07225 676 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF9P0C862 333 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TCF4P15884 667 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC2P18074 760 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 IL1R2P27930 398 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PCK1P35558 622 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ABL2P42684 1182 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 DPYSQ14117 519 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ACAP1Q15027 740 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 DPYSL2Q16555 572 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLC18A3Q16572 532 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 NPWQ8N729 165 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 OR13H1Q8NG92 308 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 HSPH1Q92598 858 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GATA6Q92908 595 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 VOPP1Q96AW1 172 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FEM1CQ96JP0 617 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 NUP85Q9BW27 656 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CALN1Q9BXU9 219 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ZWILCHQ9H900 591 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GGT7Q9UJ14 662 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.76□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ATMQ13315 3056 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 IGLON5A6NGN9 336 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 H3BRJ5 948 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 AREL1O15033 823 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 INSIG1O15503 277 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SDC3O75056 442 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 DKK1O94907 266 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PIGNO95427 931 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CYP1A2P05177 515 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 H2AFZP0C0S5 128 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ARL4AP40617 200 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 RXRGP48443 463 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 HCAR3P49019 387 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN2P57739 230 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 BNIP3Q12983 259 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SGCGQ13326 291 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FGL2Q14314 439 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GRM3Q14832 879 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CYTH1Q15438 398 aa7.75□□□□□ -1.17
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