RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 LRRN4CLQ8ND94 238 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 NSMCE3Q96MG7 304 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 FSD1LQ9BXM9 530 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 SUV39H2Q9H5I1 410 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 RAI2Q9Y5P3 530 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF10AO00220 468 aa28.05■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 LMAN1P49257 510 aa28.05■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R16AQ96I34 528 aa28.05■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa28.05■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQ67 120 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 MTAPQ13126 283 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 IHHQ14623 411 aa28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 PAF1Q8N7H5 531 aa28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 TRIM31Q9BZY9 425 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC40Q9H9A6 602 aa28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 PI15O43692 258 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 WNT3AP56704 352 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF805Q5CZA5 627 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD11Q693B1 232 aa28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 MRGPRX2Q96LB1 330 aa28.03■■■□□ 2.08
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GIPC1-201ENST00000345425 SIPA1Q96FS4 1042 aa28.01■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 CHKBQ9Y259 395 aa28.01■■■□□ 2.08
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa28.01■■■□□ 2.08
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