RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ADRB3P13945 408 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN3P26045 913 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 SUOXP51687 545 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ADPRHP54922 357 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 LAIR1Q6GTX8 287 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TTC7BQ86TV6 843 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TEKT5Q96M29 485 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 AGAP3Q96P47 875 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TRHDEQ9UKU6 1024 aa27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3EA0A087X179 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 METTL12A8MUP2 240 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3LB9A6J9 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 SOCS5O75159 536 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINF2P08697 491 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3HP0C7X1 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 RBL1P28749 1068 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 NEK5Q6P3R8 708 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PREBQ9HCU5 417 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.03■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 DOCK9Q9BZ29 2069 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN11A1L157 253 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 STK10O94804 968 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 FGGP02679 453 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 XPAP23025 273 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 DSC2Q02487 901 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC5Q12768 1159 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PID1Q7Z2X4 250 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PAF1Q8N7H5 531 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ARRDC2Q8TBH0 407 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 ECHDC3Q96DC8 303 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 FAM118BQ9BPY3 351 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa27.02■■□□□ 1.92
CRIP1-201ENST00000330233 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CES2O00748 559 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 AP1G1O43747 822 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 GJB3O75712 270 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TIMP2P16035 220 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CA4P22748 312 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DPP6P42658 865 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 LPAL2Q16609 132 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 LONRF2Q1L5Z9 754 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RASGEF1CQ8N431 466 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB119Q8N690 84 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35B2Q8TB61 432 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SPOCK2Q92563 424 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 OSBPL9Q96SU4 736 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CEP41Q9BYV8 373 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A51Q9H1U9 297 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 GLOD4Q9HC38 313 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 HOMER3Q9NSC5 361 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SNX12Q9UMY4 172 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PI4KAP42356 2102 aa27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP69A5D8W1 941 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PRLRP16471 622 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R38P59533 333 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NIPAL4Q0D2K0 466 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 UGP2Q16851 508 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 LYSMD4Q5XG99 296 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0895LQ68EN5 471 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FEM1CQ96JP0 617 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NSMCE3Q96MG7 304 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA12BQ96MM6 686 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 USP29Q9HBJ7 922 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FADS3Q9Y5Q0 445 aa27■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 KCNN4O15554 427 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN6O43657 245 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NFKBIAP25963 317 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 STIP1P31948 543 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CCR5P51681 352 aa26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms