RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049184.8

Ushbp1-201, Transcript of Usher syndrome type-1C protein-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ushbp1, Length 2,438 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cmtm6Q9CZ69 183 aa14.94□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa14.94□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa14.94□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Padi4Q9Z183 666 aa14.94□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm13040A2A8C4 496 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm13101A2ASJ0 481 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm3752A6NAT4 150 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Itih4A6X935 942 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm13119B1ARV5 481 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zbtb10E9Q8X5 861 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm6351K9J7D1 481 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Atp9bP98195 1146 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fam83hQ148V8 1209 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 B3gntl1Q3U129 357 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Mtnr1aQ61184 353 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Bend6Q6PFX2 281 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Snx17Q8BVL3 470 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ptrh1Q8BW00 204 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Itpk1Q8BYN3 419 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tmem154Q8C4Q9 181 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Dhrs4Q99LB2 279 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Acbd6Q9D061 282 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 CrotQ9DC50 612 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rmdn1Q9DCV4 305 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 CasrQ9QY96 1079 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Dnajc12Q9R022 198 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm10719E9Q7T3 227 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Sult2b1O35400 338 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp4a14O35728 507 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Emp3O35912 163 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Abcb1bP06795 1276 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 TktP40142 623 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 PhexP70669 749 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Jak2Q62120 1129 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Wdr59Q8C0M0 992 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Vmn1r205Q8R276 316 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gpn2Q8VEJ1 310 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 DhddsQ99KU1 333 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rgs10Q9CQE5 181 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gid8Q9D7M1 228 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ngly1Q9JI78 651 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 St6galnac1Q9QZ39 526 aa14.93□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Trbv4A0A075B5I2 113 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ccdc120A2AEV7 629 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 LatO54957 242 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rab10P61027 200 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 TgfbiP82198 683 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Nfatc3P97305 1075 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pfdn4Q3UWL8 134 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Lrrc8bQ5DU41 803 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Foxb2Q64733 428 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Olfr814Q7TRH4 310 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Kirrel1Q80W68 789 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Snx32Q80ZJ7 404 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Prdx6bQ8BG37 224 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Smarcal1Q8BJL0 910 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 TpbglQ8C013 384 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Dennd1cQ8CFK6 786 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 BicralQ8CHH5 1074 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Sept8Q8CHH9 429 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 OscarQ8VBT3 265 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 NpntQ91V88 561 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Smim11aQ99J19 55 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Polr3eQ9CZT4 710 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Med20Q9R0X0 212 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 St6galnac4Q9R2B6 360 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Map3k6Q9WTR2 1291 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tbc1d25A1A5B6 742 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 1700011I03RikE9PYL8 271 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm10721J3QPJ9 223 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 SpibO35906 267 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 HcrtO55241 130 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gjb1P28230 283 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Slc5a10Q5SWY8 596 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Slc20a1Q61609 681 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rbl1Q64701 1063 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Taf1cQ6PDZ2 836 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ssx9Q6XAS3 170 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fnip2Q80TD3 1108 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Dnajb13Q80Y75 316 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fra10ac1Q8BP78 315 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 SgczQ8BX51 311 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Trpv3Q8K424 791 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Stk32cQ8QZV4 488 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Bco2Q99NF1 532 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ergic3Q9CQE7 383 aa14.92□□□□□ -0.02
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tubd1Q9R1K7 455 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97.7 ms