RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 HpgdQ8VCC1 269 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 ApipQ9WVQ5 241 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dyrk1bQ9Z188 629 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r17E9PYF5 849 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn1r39G3UWE6 305 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r54K7N649 806 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 LmnaP48678 665 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mapkapk2P49138 386 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Atp6v1b2P62814 511 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gdpd4Q3TT99 632 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 CamkvQ3UHL1 512 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Prrt3Q6PE13 971 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfyve1Q810J8 777 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 GnsQ8BFR4 544 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tex46Q9CPU3 165 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lysmd1Q9D0E3 226 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fibcd1A2AV25 459 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pdk4O70571 412 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 UmpsP13439 481 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 CskP41241 450 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Eva1bQ8K2Y3 164 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trhr2Q9ERT2 382 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Yipf3Q3UDR8 347 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Glra2Q7TNC8 452 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 2310003L06RikQ9CV82 495 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Akr1c12Q9JLI0 323 aa16.36■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 PcnaP17918 261 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pkn1P70268 946 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kcnd1Q03719 651 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Akap14Q3V0I7 536 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gpr17Q6NS65 339 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trpm8Q8R4D5 1104 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lpin1Q91ZP3 924 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sfxn1Q99JR1 322 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Chmp1b1Q99LU0 199 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lrrc40Q9CRC8 602 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 DlstQ9D2G2 454 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 CdylQ9WTK2 593 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Iqca1lA6H690 825 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 BC049352E9Q2Z6 85 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ripk2P58801 539 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tas2r16P59529 299 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Aldh16a1Q571I9 802 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wdr54Q9R0D8 334 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Scnn1gQ9WU39 655 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Unc13cQ8K0T7 2210 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Apba1B2RUJ5 842 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfp839E9PUU5 921 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Prdm15E9Q8T2 1174 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm6408J3QNG1 320 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfp280bQ505F4 534 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 CcncQ62447 283 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dpy19l3Q71B07 716 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tas2r129Q7M709 320 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 ChfrQ810L3 664 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Caskin2Q8VHK1 1201 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wrnip1Q91XU0 660 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc77Q9CZH8 489 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Clec1bQ9JL99 229 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rbck1Q9WUB0 508 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Coro1cQ9WUM4 474 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Znf518bB2RRE4 1077 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm8879F6R3J9 157 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rab23P35288 237 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fmo3P97501 534 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trim35Q8C006 501 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ston1Q8CDJ8 730 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lmx1aQ9JKU8 382 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cdkl2Q9QUK0 568 aa16.35■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Klf6O08584 283 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wnt3aP27467 352 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam160a1Q505K2 1081 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ssxb3Q6XAS4 170 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Smpd4Q6ZPR5 823 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sema4fQ9Z123 777 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Spta1P08032 2415 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sec14l1A8Y5H7 715 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nsmce4aG3XA30 381 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mbl1P39039 239 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sco1Q5SUC9 284 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fcrl5Q68SN8 596 aa16.34■□□□□ 0.21
Ttl-201ENSMUST00000035812 Elp6Q8BK75 266 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.8 ms