RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PolhQ9JJN0 694 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PapolbQ9WVP6 641 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 ChkaO54804 453 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 S100bP50114 92 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PolgP54099 1218 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AdprhP54923 362 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Baiap2l2Q80Y61 522 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Xylt1Q811B1 953 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Wbp1lQ8BGW2 348 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nat14Q8BVG8 206 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Atg16l1Q8C0J2 607 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lancl3Q8CD19 420 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Clptm1Q8VBZ3 664 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PlvapQ91VC4 438 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mcoln1Q99J21 580 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Taf11Q99JX1 211 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arl2Q9D0J4 184 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slfn2Q9Z0I6 378 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn2r25W4VSP2 855 aa14.9□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zbed6D2EAC2 980 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm5689F6Y2A6 97 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nedd9O35177 833 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pold2O35654 469 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Hsd17b7O88736 334 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Myl4P09541 193 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp2a4P15392 494 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp2a5P20852 494 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nudt1P53368 156 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ptpn14Q62130 1189 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ubxn7Q6P5G6 467 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ofcc1Q8BGX4 166 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fbxw8Q8BIA4 598 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NaprtQ8CC86 538 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rprd1aQ8VDS4 312 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Marc1Q9CW42 340 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ap2b1Q9DBG3 937 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fzd2Q9JIP6 570 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nhsl2B1AXH1 854 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abhd12bG3UZN6 359 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Coro1aO89053 461 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tfap2aP34056 437 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ptpn1P35821 432 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 ItgavP43406 1044 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Eif4ebp2P70445 120 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 ScapQ6GQT6 1276 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rad54bQ6PFE3 886 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tdpoz3Q717B4 365 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam107aQ78TU8 144 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Naaladl1Q7M758 745 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ip6k2Q80V72 448 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sik2Q8CFH6 931 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Myoz3Q8R4E4 245 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Alg9Q8VDI9 611 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ogfod2Q9CQ04 349 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Znrf4Q9DAH2 327 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dpysl5Q9EQF6 564 aa14.89□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef37A1IGU4 676 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc175E9PVB3 822 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ring1O35730 406 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dpf3P58269 378 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rps24P62849 133 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pdp2Q504M2 532 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arnt2Q61324 712 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lag3Q61790 521 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tpp2Q64514 1262 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 ItpkcQ7TS72 678 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Usp43Q8BUM9 1132 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Plekhs1Q8BW88 474 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Bmt2Q8BXK4 403 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Asb14Q8C6Y6 587 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Q8CIL4 281 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rsph1Q8VIG3 301 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 SmtnQ921U8 923 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ndufb5Q9CQH3 189 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc22a17Q9D9E0 401 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc103Q9D9P2 237 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cldn2O88552 230 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rab17P35292 214 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gdf5P43027 495 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Neurog1P70660 244 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Thumpd3P97770 505 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Trappc9Q3U0M1 1148 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tmem255bQ5FW56 369 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 N4bp1Q6A037 893 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cand1Q6ZQ38 1230 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Olfr299Q7TS05 330 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zbtb41Q811F1 908 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pak5Q8C015 719 aa14.88□□□□□ -0.03
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.7 ms