Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4E4

Myoz3, Myozenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myoz3Q8R4E4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Myoz3Q8R4E4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myoz3Q8R4E4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myoz3Q8R4E4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Myoz3Q8R4E4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Myoz3Q8R4E4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myoz3Q8R4E4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myoz3Q8R4E4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Myoz3Q8R4E4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Myoz3Q8R4E4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myoz3Q8R4E4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Myoz3Q8R4E4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Myoz3Q8R4E4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myoz3Q8R4E4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Myoz3Q8R4E4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Myoz3Q8R4E4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Myoz3Q8R4E4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Myoz3Q8R4E4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Myoz3Q8R4E4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Myoz3Q8R4E4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Myoz3Q8R4E4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Myoz3Q8R4E4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Myoz3Q8R4E4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myoz3Q8R4E4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myoz3Q8R4E4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myoz3Q8R4E4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myoz3Q8R4E4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myoz3Q8R4E4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Myoz3Q8R4E4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myoz3Q8R4E4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myoz3Q8R4E4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Myoz3Q8R4E4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myoz3Q8R4E4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Myoz3Q8R4E4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myoz3Q8R4E4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myoz3Q8R4E4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myoz3Q8R4E4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myoz3Q8R4E4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Myoz3Q8R4E4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Myoz3Q8R4E4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myoz3Q8R4E4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myoz3Q8R4E4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myoz3Q8R4E4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myoz3Q8R4E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myoz3Q8R4E4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myoz3Q8R4E4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myoz3Q8R4E4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myoz3Q8R4E4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myoz3Q8R4E4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myoz3Q8R4E4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myoz3Q8R4E4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myoz3Q8R4E4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myoz3Q8R4E4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myoz3Q8R4E4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myoz3Q8R4E4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myoz3Q8R4E4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myoz3Q8R4E4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myoz3Q8R4E4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Myoz3Q8R4E4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Myoz3Q8R4E4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myoz3Q8R4E4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myoz3Q8R4E4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myoz3Q8R4E4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myoz3Q8R4E4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myoz3Q8R4E4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myoz3Q8R4E4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myoz3Q8R4E4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myoz3Q8R4E4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myoz3Q8R4E4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myoz3Q8R4E4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myoz3Q8R4E4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myoz3Q8R4E4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myoz3Q8R4E4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myoz3Q8R4E4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myoz3Q8R4E4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Myoz3Q8R4E4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myoz3Q8R4E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myoz3Q8R4E4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myoz3Q8R4E4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myoz3Q8R4E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myoz3Q8R4E4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myoz3Q8R4E4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Myoz3Q8R4E4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myoz3Q8R4E4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myoz3Q8R4E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myoz3Q8R4E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myoz3Q8R4E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myoz3Q8R4E4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myoz3Q8R4E4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myoz3Q8R4E4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myoz3Q8R4E4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myoz3Q8R4E4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myoz3Q8R4E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myoz3Q8R4E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myoz3Q8R4E4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms